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海南省疾控中心是经海南省政府批准设立的公益一类事业单位，现隶属于海南省疾病预防控制局，2023年8月10日加挂海南省预防医学科学院牌子。中心成立于 2002年6月，由原海南省卫生防疫站、海南省结核病防治研究所、海南省健康教育所和海南省热带病防治研究所合并组建而成，2010 年 8 月正式升格为副厅级事业单位。